Mars’a İşaret mi? Yüksek Rakımlı Göl Mikropları Dünya Dışı Yaşamın İpuçlarını Verebilir
Mükemmel şekilde adapte olmuş mikroorganizmalar, derin deniz çukurlarından dağ zirvelerine kadar ekstrem ortamlarda yaşarlar. Bu ekstremofillerin düşmanca koşullarda nasıl hayatta kaldıkları hakkında daha fazla bilgi edinmek, bilim insanlarını Dünya’daki yaşam ve diğer gezegenlerdeki potansiyel yaşam hakkında bilgilendirebilir.
Journal of Proteome Research dergisinde araştırmacılar, genetik materyal yerine protein parçalarına dayalı daha doğru ekstremofil tanımlaması için bir yöntem detaylandırıyor. Çalışma, Mars’ın erken dönemlerine benzer bir ortam olan Şili’deki yüksek rakımlı göllerden iki yeni dayanıklı bakteri tanımladı.
İnsanlar aşırı sıcak, soğuk veya yüksek rakımlı bölgelere yerleşmekten kaçınma eğiliminde olsalar da, bazı mikroorganizmalar bu tür zorlu yerlerde yaşamaya adapte olmuşlardır. Bu ekstremofil mikroplar, diğer gezegenlerde yaşam arayışında olan astrobiyologların ilgisini çekmektedir.
Araştırmacılar şu anda DNA’larına dayanarak Dünya’ya bağlı mikropları tanımlamak için bireysel gen dizilimi kullanmaktadır. Ancak mevcut yöntemler birbiriyle yakından ilişkili ekstremofil türlerini ayırt edemiyor. Bu nedenle, Ralf Moeller ve meslektaşları bir ekstremofili gen dizisi yerine protein imzasını kullanarak tanımlayıp tanımlayamayacaklarını araştırdılar.
Araştırmacılar gösterilerine Şili Altiplano’sunda deniz seviyesinden 2,3 milden daha yüksekte bulunan beş yüksek rakımlı And gölünden aldıkları su örnekleriyle başladılar. (Referans olarak, Denver deniz seviyesinden yaklaşık bir mil yüksektedir.) Araştırmacılar örneklerden 66 mikrop üretmiş ve ardından iki yöntemden hangisinin mikroorganizmaları daha iyi tanımladığını belirlemiştir:
Geleneksel gen dizilimi, her bir örnekten elde edilen 16S rRNA geninin (dizilime dayalı mikrop analizi için tipik bir gen) nükleotidlerini tanımlama için bir veri tabanıyla karşılaştırdı.
Daha yeni olan “proteotipleme” tekniği, peptit imzaları üretmek için peptit olarak bilinen protein parçalarını analiz etti ve ekip proteom veri tabanlarından mikroorganizmaları tanımlamak için kullandı.
Araştırmacılar bu yöntemlerle, yüksek rakımlı göl örneklerinden yetiştirilen 66 mikroorganizmadan 63’ünü tanımladı. Genetik bilgileri mevcut veri tabanında bulunmadığı için gen dizilemesinin tanımlayamadığı üç mikroorganizma için proteotipleme, potansiyel olarak iki yeni ekstremofil bakteri türü tanımladı.
Bu sonuçlar, proteotiplemenin küçük biyolojik örneklerden ekstremofil mikroorganizmaları tanımlamak için daha eksiksiz bir çözüm olabileceğini göstermektedir. Ekip, protein profillemenin bir gün dünya dışı yaşamı aramamıza ve tanımlamamıza ve kendi gezegenimizdeki biyolojik çeşitliliği daha iyi keşfetmemize yardımcı olabileceğini söylüyor.
Derleyen: Deniz KAFKAS
Kaynak: Mars’a İşaret mi? Yüksek Rakımlı Göl Mikropları Dünya Dışı Yaşamın İpuçlarını Verebilir
Aztek Öncesi Güçlü Bir İmparatorluğa İlham Veren “Kan Aynası Kültü”
Aztek Öncesi Güçlü Bir İmparatorluğa İlham Veren “Kan Aynası Kültü”