Gizli Taşıyıcı: DNA’nızda Saklı Kanser Riski
Yeni bir araştırma, doğumda miras aldığımız genlerin kanser üzerinde daha önce düşünülenden çok daha büyük bir rol oynadığını ortaya koydu. Genler yalnızca tümörlerin nasıl oluştuğunu ve evrimleştiğini değil, aynı zamanda tedaviye nasıl yanıt verdiklerini de etkiliyor.
Yaşam boyunca edinilen mutasyonlara odaklanan çoğu kanser araştırmasının aksine, bu çalışma milyonlarca kalıtsal varyantı ve bunların tümörlerdeki protein aktivitesi üzerindeki etkilerini araştırdı. Bulgular, her kişinin benzersiz genetik geçmişini hesaba katarak kanseri teşhis etme ve tedavi etme şeklimizi değiştirebilir; yalnızca tümörün mutasyonlarını değil. Bu, gerçekten kişiselleştirilmiş, tüm vücudu kapsayan kanser bakımına doğru bir değişimdir.
Kalıtsal Genler ve Kanserin Gizli Etkisi
Ulusal Kanser Enstitüsü Klinik Proteomik Tümör Analizi Konsorsiyumu (CPTAC) ile işbirliği içinde Mount Sinai’deki Icahn Tıp Fakültesi’ndeki araştırmacılar tarafından yürütülen yeni bir uluslararası çalışma, doğumda kalıtılan, germ hattı genetik varyantları olarak bilinen genlerin, daha önce bilinenden çok daha önemli bir rol oynadığını ortaya koydu.
Bugün yayımlanan çalışma, milyonlarca kalıtsal genetik farklılığın tümörlerin içindeki binlerce proteinin aktivitesini nasıl etkileyebileceğini gösteren ilk çalışmadır. 10 kanser türünde 1.000’den fazla hastadan alınan verileri analiz eden araştırmacılar, bir kişinin kalıtsal DNA’sının kanserinin nasıl geliştiğini ve davrandığını şekillendirebileceğini buldu.
10 kanser türü ve mevcut veri türleri arasında farklı genetik kökenlere sahip 1.064 kişiden oluşan CPTAC kohortuna genel bakış. Üst dağılımdaki renkler genetik kökene atıfta bulunur: Afrika kökeni (AMR); AdMixed Amerikan (AMR); Doğu Asyalı (EAS); Avrupalı (EUR); Güney Asyalı (SAS). Kaynak: Martins Rodrigues, Wyczalkowski ve Terekhanova ve diğerleri, Cell.
Kişiselleştirilmiş Kanser Bakımının Yeniden Tanımlanması
Bu içgörüler kanser bakımını dönüştürebilir. Günümüzde, tedavilerin çoğu tümörün kendisinde bulunan genetik mutasyonlar tarafından yönlendiriliyor. Bu araştırma, bir hastanın kalıtsal genetik geçmişinin de dikkate alınmasının kanserlerin nasıl teşhis edildiğini, riskin nasıl değerlendirildiğini ve tedavilerin nasıl seçildiğini iyileştirebileceğini öne sürüyor.
“Her insan doğumdan itibaren benzersiz bir genetik varyant kombinasyonu taşır ve bu kalıtsal farklılıklar hücrelerimizin yaşam boyunca nasıl işlediğini sessizce şekillendirir,” diyor eş-karşılıklı çalışma yazarı Dr. Zeynep H. Gümüş, Mount Sinai’deki Icahn Tıp Fakültesi’nde Genetik ve Genomik Bilimler Doçenti. “Gösterdiğimiz şey, bu varyantların sadece arka planda durmadığıdır; tümörlerin nasıl oluştuğunda, nasıl evrimleştiğinde ve hatta tedaviye nasıl yanıt verdiğinde aktif bir rol oynayabilirler. Bu, yalnızca tümörün kendisine değil, aynı zamanda hastanın altta yatan genetik yapısına göre kanser bakımının uyarlanması için yeni olasılıklar açıyor.”
Somatik Mutasyonlardan Kalıtsal Varyantlara
Şimdiye kadar, kanser araştırmalarının çoğu, bir kişinin yaşamı boyunca hücrelerde meydana gelen değişiklikler olan somatik mutasyonlara odaklanmıştı. Ancak araştırmacılar, kalıtsal germ hattı varyantlarının somatik mutasyonlardan çok daha fazla olduğunu ve kanser üzerindeki etkilerinin yeterince anlaşılmadığını söylüyor.
Araştırmayı yürütmek için araştırmacılar, belirli kalıtsal mutasyonların kanser hücrelerindeki proteinlerin yapısını, kararlılığını ve işlevini nasıl düzenlediğini incelemelerini sağlayan hassas peptidomik olarak bilinen gelişmiş bir teknik kullandılar. 330.000’den fazla protein kodlayan germ hattı varyantını haritalayarak, ekip bu kalıtsal farklılıkların protein aktivitesini nasıl değiştirebileceğini, gen ifadesini nasıl etkileyebileceğini ve hatta tümörlerin bağışıklık sistemiyle nasıl etkileşime gireceğini nasıl yönlendirebileceğini ortaya çıkardı.
Kanserin Vahşi Değişkenliğini Açıklamak
Dr. Gümüş, “Çalışmamız, kalıtsal DNA değişikliklerinin genlerin nasıl ifade edildiğini ve proteinlerin (kanser davranışının temel itici güçleri) tümörlerde nasıl üretildiğini ve değiştirildiğini etkileyebileceğini göstererek senaryoyu tersine çeviriyor. Bunu yaparken, bu varyantlar doktorların kanserin bir hastadan diğerine nasıl göründüğü, ilerlediği ve tedavilere nasıl yanıt verdiği konusunda gördükleri geniş çeşitliliğin bir kısmını açıklamaya yardımcı oluyor” diyor.
Araştırma, kişiselleştirilmiş kanser bakımının yalnızca tümörün mutasyonlarını değil, aynı zamanda kişinin genetik geçmişini de hesaba katması gerektiğine dair artan kanıtlara katkıda bulunuyor. Ancak araştırmacılar, çalışmanın bulgularının öncelikle Avrupa kökenli bir kohorttan alınan verilere dayandığı ve bu içgörülerin çok kökenli popülasyonlara uygulanmasını sağlamak için daha fazla araştırmaya ihtiyaç duyulduğu konusunda uyarıyor.
Bütünsel Kişi Hassas Tıbbı
“Bu, sadece kanseri değil, tüm bireyi dikkate alan hassas tıbba doğru atılmış büyük bir adımdır,” diyor çalışmanın ortak birinci yazarı ve Mount Sinai’deki Icahn Tıp Fakültesi’nde Genetik ve Genomik Eğitmeni olan Myvizhi Esai Selvan, PhD. “Kanser evriminde, kalıtsal genom sahneyi hazırlar. Hangi mutasyonların önemli olduğunu, bir tümörün ne kadar agresif olabileceğini ve vücudun bağışıklık sisteminin nasıl tepki vereceğini belirlemeye yardımcı olur.”
Ekip şu anda bu içgörüleri iki ana alanda uygulamak için çalışıyor:
Kanser immünoterapisi: Ulusal Kanser Enstitüsü’nün Kanser Bağışıklık İzleme ve Analiz Merkezleri ile ortaklaşa olarak, araştırmacılar bazı hastaların immünoterapiye iyi yanıt verirken diğerlerinin neden yanıt vermediğini araştırıyor; kalıtsal genetik farklılıkların anahtar olabileceği bir alan. Akciğer kanseri riski tahmini: Mount Sinai Milyon Sağlık Keşifleri Programı ve Milyon Gaziler Programı aracılığıyla araştırmacılar, bir kişinin kalıtsal genetik profiline dayanarak akciğer kanseri riskini tahmin etmek için hesaplamalı modeller geliştiriyorlar. Bu araçlar, erken taramadan kimin en çok faydalanacağını belirlemeye yardımcı olabilir ve erken tespit yoluyla sonuçları iyileştirebilir.
Kaynak: https://scitechdaily.com