Bir Gölette Keşfedilen Minik Organizma Tarafından DNA Kuralları “Yeniden Yazıldı”
DNA kurallarının değişmez olduğunu düşünebiliriz, ancak İngiltere’nin Oxford kentindeki bir park göletinde bulunan mikroskobik bir organizmanın genetik kodu, bilimin her zaman değiştiğini bir kez daha kanıtladı.
Dr. Jamie McGowan ile Earlham Enstitüsü ve Oxford Üniversitesi’nden bir grup araştırmacı, başlangıçta tek hücreli organizmalar gibi çok küçük miktarlardaki DNA’ları dizilemenin yeni bir yolu üzerinde çalışıyorlardı.
Yöntemlerini test etmek için bir şey isteyen ekip, Oxford Üniversitesi Parkları’ndaki bir tatlı su havuzundan bir protist izole etti. Protistin ne olduğunu merak ediyorsanız, McGowan’ın yararlı (ya da nasıl baktığınıza bağlı olarak değil) bir açıklaması var:
McGowan yaptığı açıklamada, “Protist tanımı gevşektir – esasen hayvan, bitki veya mantar olmayan herhangi bir ökaryotik organizmadır” dedi. “Bu tanımın çok genel olduğu açıktır ve bunun nedeni protistlerin son derece değişken bir grup olmasıdır.
“Bazıları hayvanlarla, bazıları da bitkilerle daha yakından ilişkilidir. Avcılar ve avlar, parazitler ve konakçılar, yüzücüler ve oturanlar var ve diğerleri fotosentez yaparken çeşitli diyetlere sahip olanlar var. Temel olarak, çok az genelleme yapabiliriz.”
Protistin genomunu analiz eden McGowan, bunun sadece yepyeni bir tür olan Oligohymenophorea sp. PL0344 olduğunu değil, aynı zamanda genetik kodunda da benzersiz bir farklılaşma olduğunu keşfetti.
Bizi okula geri götürüyor
DNA transkripsiyonu ve proteinlere çevrilmesini okulda öğrenmiş olabilirsiniz, ancak Teknoloji Ağları tarafından küçük bir tazeleme asla yanlış gitmez.
DNA bir yemek tarifi gibidir. Transkripsiyon biraz da bu tarifi okumak ve birkaç değişiklikle kopyalamak gibidir – kopya RNA’dır, burada T yerine U harfi vardır. Bir cümlenin sonunda nokta buluruz ve bunun DNA versiyonu bir genin sonunun nerede olduğunu bize söyleyen üç harfli bir dizi olan bir dur kodonudur. RNA, bir proteinin yapı taşları olan amino asitlere çevrilirken, dur kodonu küçük protein şeflerine (diğer adıyla ribozomlara) nerede durmaları gerektiğini söyler.
Dur kodonları TAA, TAG ve TGA neredeyse tüm organizmalarda bulunur ve özellikle ilk ikisinin güçlü bir şekilde bağlantılı olduğu düşünülmektedir; biri değişmeden diğeri de değişmez.
McGowan, “Bildiğimiz hemen hemen her durumda, TAA ve TAG birlikte değişiyor” dedi. “Dur kodonları olmadıklarında, her biri aynı amino asidi belirtir.”
Yeni bir genetik keşif
Ancak Oligohymenophorea sp. PL0344 bu eğilime karşı çıkıyor – bu bir siliyat, DNA’sında genellikle değişiklikler olan bir tür suda yaşayan protist. Genomunda sadece TGA bir dur kodonu kodlar ve normalde ikiz olan TAA ve TAG iki farklı amino aside çevrilir. Ayrıca protist genomunda beklenenden daha fazla TGA kopyası var ve araştırmacılar bunun diğer iki durdurma kodonunun eksikliğini telafi etmek için olduğuna inanıyor.
McGowan, “Bu son derece sıra dışı bir durum,” diye açıkladı. “Bu durdurma kodonlarının iki farklı amino asitle bağlantılı olduğu başka bir durumdan haberdar değiliz. Gen çevirisi hakkında bildiğimizi düşündüğümüz bazı kuralları yıkıyor – bu iki kodonun birbirine bağlı olduğu düşünülüyordu.”
Araştırmacıların Oligohymenophorea sp. PL0344’te buldukları anomali türleri gelecekteki genetik keşifler için ilham kaynağı olabilir.
“Bilim insanları yeni genetik kodlar üretmeye çalışıyor ama bunlar doğada da var. Eğer ararsak bulabileceğimiz büyüleyici şeyler var.
“Ya da bu durumda,” diye düşündü McGowan, “biz onları aramadığımız zaman.”
Kaynak: https://www.iflscience.com
Derleyen: Figen Berber
Mağaradaki Kan ve Kir Örneklerinden Neandertallerin DNA’larına Ulaşıldı