Zombi Virüslerinin Antik Genleri Kanserin Gizli Sürücüleri Olarak Ortaya Çıktı
Virüsler bizi ziyaret ettiklerinde, bazen arkalarında kendilerinden parçalar bırakırlar. Genomlarımızda sessizce saklanan bu yabancı DNA parçalarından bazıları nesiller boyunca aktarılabilir. Uzun zamandır aktif olmadıkları düşünülüyordu, ancak o zamandan beri bu kaçak dizilerin her türlü tahribata yol açmak için geri dönebileceğini öğrendik.
Colorado Üniversitesi’nden biyoinformatikçi Atma Ivancevic liderliğindeki araştırmacılar, kanserlerin bu zombi virüs parçalarından bazılarını kendi yararlarına kullanabileceklerini keşfetti.
Genom biyoloğu ve kıdemli yazar Edward Chuong, “Çalışmamız, günümüzdeki hastalıkların, yakın zamana kadar çok az araştırmacının dikkatini çeken bu eski viral enfeksiyonlardan önemli ölçüde etkilenebileceğini gösteriyor” diyor.
Uzun zamandır ‘önemsiz’ DNA olarak kabul edilen, endojen retrovirüsler (ERV’ler) olarak bilinen virüs artıkları parçacıklarına, plasentanın evrimini teşvik ettikleri için memeliler olarak varlığımızı borçluyuz. Onlar olmasaydı insan olamazdık. Ancak çoğu şeyde olduğu gibi ERV’lerin de henüz yeni yeni anlamaya başladığımız bedelleri var.
Chuong, “Kanser hücrelerinin açık olmaması gereken pek çok geni ifade ettiğini biliyoruz, ancak kimse bunları neyin açtığını gerçekten bilmiyor” diye açıklıyor. “Onları çalıştıran anahtarların çoğunun bu eski virüslerden türediği ortaya çıktı.”
Ivancevic ve ekibi, 21 farklı kanser türünün epigenomlarına ilişkin yayınlanmış veri kümelerini analiz etti ve uzun terminal tekrar 10 (LTR10) adı verilen belirli bir ERV ailesinin çok yüksek seviyelerde aktif olduğunu görünce şaşırdılar. Orijinal virüs yaklaşık 30 milyon yıl önce primat atalarımızı enfekte etmiştir.
Kolorektal kanser dokularından oluşan bir hücre hattı üzerinde yapılan işlevsel bir çalışma, LTR10’un tümörlerin oluşumunda yerleşik rolleri olan genlerin ifadesini düzenlediğini ortaya koydu. Ölümsüz LTR10 genleri insan kolorektal tümör hücrelerinde ve farelerde etkisiz hale getirildiğinde, tedavi direncinde rol oynadığı bilinen XRCC4 de dahil olmak üzere kanserin büyümesine neden olan genler de devre dışı bırakıldı. Bu da farelerdeki tümörleri küçülten tedavilerin daha iyi sonuç vermesini sağladı.
Ivancevic ve ekibi, LTR10’un bu genleri kontrol etmek için epigenetik bir anahtar görevi gördüğü sonucuna varıyor. Kanserler bu atılmış virüs parçalarını tümörlerdeki gen ifadesi kalıplarını değiştirmek için kullanıyor gibi görünüyor; sadece bir retrovirüs ailesi kanserle ilişkili 70 kadar şaşırtıcı geni düzenliyor.
Ivancevic ve ekibi, LTR10’un tümör hücrelerinde hangi genleri düzenlediğini söyleyebilseler de, bu genlerin söz konusu kanserin büyümesi ve yayılmasıyla ilişkili olduğunu doğrudan doğrulayamadılar. Bu bağlantıları kurmak için hastadan türetilmiş organoidler üzerinde daha fazla çalışma yapılmasını öneriyorlar.
Araştırmacılar, yaşlandıkça, savunmamız bozuldukça bu zombi virüs parçalarının daha fazlasının hayata dönebileceğinden ve yaşamın ilerleyen dönemlerinde başka sağlık sorunlarına katkıda bulunabileceğinden şüpheleniyorlar. Bilim insanları yavaş ama emin adımlarla bu karmaşık durumların ardında yatan biyolojimizin daha belirsiz kısımlarına odaklanıyor.
Derleyen: Deniz KAFKAS
Kaynak: Zombi Virüslerinin Antik Genleri Kanserin Gizli Sürücüleri Olarak Ortaya Çıktı